毛巾有下水道的味道主要還是因為衛生間不透風，長時間潮濕導致的。最好的辦法就是注意保持衛生間的干燥通風，毛巾在浴室放置一段時間后，要拿出去曬曬太陽，去除霉菌。還可以用白醋浸泡毛巾半小時，然后拿著毛巾的一個角掄著圈甩一會兒，把毛巾上的小線圈都甩開了，晾干再用，這時毛巾摸上去會感覺松軟，還可以防止滋生細菌。
毛巾長期處在潮濕環境，在加上不通風，是會有很重的異味的。毛巾是纖維織物，使用時間長了，深入纖維縫隙內的細菌很難清除，而清洗、晾曬、高溫蒸煮等方式只能在短時間內控制細菌數量，并不能永久清除細菌。長期使用舊毛巾的話，會給細菌入侵造成機會，所以，最好三個月左右換一塊新毛巾。
衛生間本來就是一個排污的地方，要是沒有經常清洗衛生間的話難免會有一股臭味，所以可想而知毛巾放在衛生間多少都會吸收一些味道。還有毛巾沾了水，沒有及時晾干，而且放在比較潮濕的衛生間，也會產生一股異味。對于毛巾難聞的味道，可以用洗衣粉之類的洗滌劑浸泡半小時，然后清洗，最后晾干，最好是在通風的太陽光下曬，可以達到殺菌的效果。有條件的話，洗之前先用84消毒液等帶有氯化物的消毒用品浸泡20分鐘，晾干后就沒味兒了。而且毛巾使用過之后，一定要掛起來晾干，不要弄成一堆，就不會產生難聞的氣味了。
如果毛巾長時間放在衛生間，不僅有味道還會滋生細菌，必須定期對毛巾殺毒，可采用煮毛巾消毒法，大概每一個月煮一次毛巾，將毛巾放入鍋中，倒入開水，并放入少許鹽，先開大火煮開，然后轉成中火繼續煮15分鐘，煮好后待水冷涼，將毛巾取出，擰干水分，晾曬到太陽下曬干，可以起到消毒除菌的作用。