濾芯式凈水器缺點：1、不能去除水中的鈣鎂離子（水堿）。2、凈化后的水過于純，缺少對人體有益的微量元素，平均出一杯純水，要產生3杯廢水，同時必須用電；并且機器本身的維護成本也比較高，因為管件接頭比較多，容易出現滲水等小問題。3、不能祛除細菌、病毒、有機物，不建議直接生喝；再生時需要耗鹽；并產生一定量的廢水。4、有腸胃疾病的人慎用，因為磁化水對腸胃有一定的刺激。5、凈化精度不是特別高，如果用來處理飲用水，效果不是特別好。6、成本高（普通的大概在6千多），同時水的酸堿值也取決于電解板，需要用電。并且建議在醫生的指導下使用，盲目使用對有些人的體質不適宜可能有副作用。當然，不是所有的凈水器品牌產品都存在以上問題，像美國知名凈水器品牌潤索凈水器可有效去除水中余氯、異味、鉛、石棉、病毒、混濁物、六氯化苯、三氯甲烷等致癌及揮發性物質，并保持水中微量元素和礦物質。在飲水處理的基礎上進一步改善水質的口感，使家庭飲水達到盡善盡美的效果。

濾芯式凈水器價錢較低，過濾效果好，但是也有一些缺點：濾芯使用壽命比較短，要定期更換濾芯，一般使用期限為1-2年，且不得超過2年；不能除去水中的鈣鎂離子；而且濾芯容易受到污染，易滋生細菌，使用時間久會在濾芯上結垢，導致過濾效果降低，細菌污染水質。

凈水機的種類有多種，不同種類的缺點也不一樣：1、超濾膜凈水機——缺點：不能去除水中的鈣鎂離子（水堿）。2、純水機——缺點：凈化后的水過于純，缺少對人體有益的微量元素，平均出一杯純水，要產生3杯廢水，同時必須用電；并且機器本身的維護成本也比較高，因為管件接頭比較多，容易出現滲水等小問題。3、軟水機——缺點：不能祛除細菌、病毒、有機物，不建議直接生喝；再生時需要耗鹽；并產生一定量的廢水。4、磁化水機——缺點：有腸胃疾病的人慎用，因為磁化水對腸胃有一定的刺激。5、中央凈水器——缺點：凈化精度不是特別高，如果用來處理飲用水，效果不是特別好。6、離子水機——缺點：成本高（普通的大概在6千多），同時水的酸堿值也取決于電解板，需要用電。并且建議在醫生的指導下使用，盲目使用對有些人的體質不適宜可能有副作用。當然了，不是所有的凈水器品牌產品都存在以上問題，像美國知名凈水器品牌潤索凈水器可有效去除水中余氯、異味、鉛、石棉、病毒、混濁物、六氯化苯、三氯甲烷等致癌及揮發性物質，并保持水中微量元素和礦物質。在飲水處理的基礎上進一步改善水質的口感，使家庭飲水達到盡善盡美的效果。